C57BL / 6J é a cepa endogâmica mais amplamente utilizada e a primeira a ter seu genoma sequenciado. Embora esta cepa seja refratária a muitos tumores, é um fundo permissivo para a expressão máxima da maioria das mutações. Camundongos C57BL / 6J são resistentes a convulsões audiogênicas, têm densidade óssea relativamente baixa e desenvolvem perda auditiva relacionada à idade. Eles também são suscetíveis à obesidade induzida por dieta, diabetes tipo 2 e aterosclerose. Os macrófagos dessa cepa são resistentes aos efeitos da toxina letal do antraz.